Die Geschichte beginnt auf der Erde. Jake Sullyist ein Soldat der nichts gefunden hat was wert wäre zu kämpfen. Durch eine Verletzung verliert er sein Bein. Als die Chance kommt zum Planten Pandora zu reisen um an einem Bergbau zu arbeiten, stimmt er zu. Was an Pandora so wichtig ist? Ein Mineral, das es nirgendwo anders gibt. Pandora ist ein üppiger, aber schroffer Planet. Die Luft ist giftig für die Menschen, die Pflanzen und Kreaturen sind sehr gefährlich. Die Ureinwohner, blaue, riesige und menschenähnliche Kreaturen, die Na'vi genannt werden, sind nicht gerade erfreut über die Anwesenheit der Menschen.
Weil der Planet so gefährlich ist, wurden spezielle Anzüge entwickelt um die Bergabaurbeiter zu schützen. Eine Art von Klon-Programm wurde entwickelt welche die DNA von Menschen und Na'vi kombiniert. Das Resultat ist ein geklonter Na'vi der ein Bewusstsein hat das dem originalen, menschlichen Klon-Material entspricht. Jake's Bruder war Original-Geber und kontrollierte so einen Avatar. Da sein Bruder verstorben ist, fragte die Firma Jake ob er nach Pandora kommen will, da er die entsprechende DNA hat.
Einige Jahre später: Jake trifft auf Pandora ein. Er findet einen Ort von unbeschreiblicher Schönheit, wo die Wälder voller wilder Farben und Formen sind und die Flora und Fauna des Planeten in der Nacht biolumiszenieren und so einen leuchtenden Garten voller Wunder kreieren. Berge und riesige Bäume strecken sich bis zu dem Himmel. Als Jake für die Bergbau-Firma arbeitet, trifft er auf einen ViperWolf, einer von Pandora's vielen Gefahren. Bevor die Kreatur Jake angegreifen kann, wird diese von einem Pfeil getötet. Dieser wurde von der weiblichen Na'vi abgefeuert, durch die Jake die wahren Seite des Planeten kennenlernt.
Die Na'vi leben in einer idealistischen Harmonie mit den Kreaturen von Pandora. Durch seine Rettung, sieht Jake die Arbeiten im Bergbau in einem neuen Licht. Er hat endlich etwas gefunden das es wert ist dafür zu kämpfen. Aber den Na'vi's zu helfen hätte einen großen Preis: Er könnte nicht für immer mit seinem Avatar bleiben. Wenn der Avatar schläft, erwacht Jake in seinem menschlichen Körper und befindet sich an einer Schnittstelle um sein Bewusstsein und den Avatar zu verbinden. Falls er die Na'vi im Krieg gegen die Menschen helfen wird, wird er die Option verlieren sein Avatar zu betretten und würde dort als bewegungslose Person festsitzen, ohne die Na'vi die er liebt...
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